元至明朝，正一道继续发展。宋朝末年，元世祖遣使臣王一清入龙虎山，向三十五代天师张可大密求符命。世祖建立元朝后，召见三十六代天师张宗演，命其主领江南道教，仍赐银印。武宗即位时，召第三十八代张与材入觐，“特授金紫光禄大夫，封留国公，赐金印”。元朝统治者对天师道的扶持几乎是代代相传，基本上每位帝皇对天师世系都有封赠。有元一代，正一道教地位显赫，受到了皇权的认可崇奉，进一步巩固了其在道教中的领导地位。入明之后，太祖朱元璋称帝之前，就曾派遣使者诣四十二代天师张正常，请发上天文书，授以“天运有归”符命，以制造君权神授的舆论氛围。洪武元年（1368），朱元璋授张正常正一嗣教真人，永掌天下道教事，赐银印，秩视二品，设僚佐，曰赞教，曰掌书，定为制。天师出入皆驿马车船，待遇极高。朱元璋还赐银重修天师府第，为历代天师撰写赞词。正统二年（1437）正月，明英宗赐宴第四十五代天师张懋丞，并特召圣人后裔衍圣公同宴，各赐蟒衣、朱履，进一步确定了“南张北孔”两大世家的格局。四十六代天师张元吉于成化三年（1467）所受的封号达25个字，从四十七代到五十代天师的婚娶礼仪都由皇帝主持，皇族闺秀碑许配给天师。
